Héritière d'une riche tradition d'enseignement (par exemple, Maurice Merleau-Ponty, Gilles Deleuze, Geneviève Rodis-Lewis, Henri Maldiney, François Tricaud, François Dagognet, Bernard Bourgeois...), elle offre une formation philosophique complète, de la première année de Licence au Doctorat, axée sur les disciplines philosophiques fondamentales (métaphysique, histoire de la philosophie, esthétique, philosophie morale et politique, logique, épistémologie) et ouverte sur les problèmes contemporains (santé, développement durable, esthétique et culture visuelle) à travers une variété de Masters, qui permettent aussi d'accueillir des étudiants issus de Licences autres que philosophiques.
Elle se distingue aussi comme centre d'excellence pour la préparation aux concours de recrutement aux métiers de l'enseignement (avec chaque année des lauréats au CAPES et à l'Agrégation), par son offre de formation professionnalisante dès le Master 1, par ses nombreuses conventions internationales qui permettent de valider une partie de la scolarité à l'étranger. Elle attire de plus en plus d'étudiants étrangers, grâce notamment à une politique dynamique de co-tutelles de thèse.
La Faculté de philosophie est devenue aussi un des centres de recherche et de formation doctorale parmi les plus importants. L'Institut de recherches philosophiques de Lyon organise chaque année de nombreux colloques internationaux, des journées d'études et des séminaires, intégrés à la scolarité.
Près d'une centaine de doctorants français et étrangers préparent une thèse dans le cadre de l'École doctorale de philosophie, qui regroupe les universités Jean Moulin Lyon 3 et Grenoble Alpes ainsi que l’École Normale supérieure.